Kaum sind die Cassul-Geschwister Pacifica, Shannon und Raquel dem Massaker der kirchlichen Inquisitoren in der Stadt Taurus entkommen, spielen sie mit dem Gedanken, ihren aufdringlichen Begleiter, Ritterlehrling Leopold Scorpos, loszuwerden. Dieser weiß zwar nicht, wer Pacifica in Wirklichkeit ist, aber das scheint nur eine Frage der Zeit. Just in dem Augenblick treffen sie auf einen der zahlreichen Verfolger, den Kopfgeldjäger Kidaf Gillot, der die Macht der Musik und seltsame, fliegende Maschinen als Waffen benutzt.
Pacifica wird tödlich vergiftet und Rauqel und Leopold setzen alles daran, ihr zu helfen. Der ehemalige Ritter und jetzige Arzt Doyle Barrett soll Pacificas Leben retten. Doch Gillot ist ihnen einen Schritt voraus.

In der zweiten Episode muss Leopold mit der neuen Enthüllung über seine Angebetete Pacifica fertig werden. Was verlangt die Ehre eines Ritters in so einem Augenblick? Während er noch hin und her gerissen ist, schreitet der mysteriöse „Friedensstifter“ Galil, der von dem Oberhaupt der Kirche des Mauser als „Gottes Gesandter“ gesehen wird, zur Tat.


Mit Hilfe seiner gewaltigen Kräfte entführt er Pacificas Geschwister und will sie damit in eine Falle locken, da er offenbar keine Macht über die „Scrapped Princess“ selber ausüben kann. Pacifica wendet sich in ihrer Verzweiflung an Leo, doch ob ihr dieser helfen wird?
Zefiris, das geheimnisvolle schwebenden Mädchen, das die Reise der Cassuls schon länger verfolgt, mischt sich ebenfalls in die Auseinandersetzung mit Galil ein.

Im abschließenden Handlungsbogen quartieren sich die Geschwister auf der Flucht in einem verlassenen Schloss ein. Finanzielle Schwierigkeiten zwingen sie dazu, ihre Kutsche zu verkaufen und zu allem Überfluss bringt Shannon aus der nahen Stadt ein kleines Waisenmädchen namens Cin mit, das ihm gegen seinen Willen gefolgt ist.
Natürlich ist Pacifica über die neue Konkurrenz um die Aufmerksamkeit ihrer Geschwister nicht glücklich. Aber als Zefiris wieder einmal aus dem Nichts auftaucht und sie bittet, Cin umzubringen, ist sie mehr als schockiert. Steckt hinter dem kleinen Mädchen mehr, als es den Anschein hat?


So langsam nimmt die Geschichte der „Scrapped Princess“ Form an. Die übernatürlichen Ereignisse, welche die Reise der Cassul-Geschwister begleiten, werden häufiger und gefährlicher. Von Menschen kontrollierte Miniatur-Roboter und die gewaltigen „Friedensstifter“, die Mausers Willen durchsetzen, wecken neue Zweifel. Ist die Magie Providences in Wirklichkeit hoch entwickelte Technologie? Und wenn ja, wer hat diese dann überhaupt erfunden?

Die Jagd nach Pacifica nimmt Ausmaße an, bei der ihre Jäger immer weniger Rücksicht auf Menschenleben nehmen. Die Cassul-Geschwister kommen nicht umhin, die Frage nach der wahren Natur der „Scrapped Princess“ zu stellen. Nach allem, was sie erleben und durchmachen mussten, bleibt kaum ein Zweifel, dass sogar die himmlischen Mächte persönlich Pacifica nach dem Leben trachten. Allein diese Tatsache erhöht die Wahrscheinlichkeit, dass Shannons und Raquels Schwester wirklich die „Prinzessin der Zerstörung“ ist – etwas, was die Cassuls bisher erfolgreich verdrängen konnten.


Trotz allem bleiben sie ihrer Schwester treu. Shannon bekommt durch die mysteriöse Zefiris sogar eine mächtige neue Fähigkeit, mit der er selbst den „Friedensstiftern“ Widerstand leisten kann. Abgesehen davon und der Einführung des kleinen Mädchens Cin als neuer Charakter bleibt die Gruppendynamik in der kleinen Familie größtenteils unverändert.